程京（1963.7.14—），医学生物物理学（生物芯片方向）专家。
安徽省安庆市人。1983年毕业于上海铁道大学（同济大学）电气工程系。
1992年获英国史查克莱大学司法生物学博士学位。现任清华大学医学院生物医学工程系及医学系统生物学研究中心教授、博士生导师，生物芯片北京国家研究中心主任。
任IET-Nanobiotechnology和Human Mutation杂志编委，全国生物芯片标准化技术委员会主任委员、中国医药生物技术协会生物芯片分会主任委员、863计划生物和医药技术领域专家组专家、发改委国家生物产业发展咨询委员会专家。
2009年当选为中国工程院院士。
从事基础医学和临床医学相关生物技术研究，在生物芯片的研究中有重要建树和创新。
回国前他关于“芯片实验室”研究成果发表在1998年的Nature Biotechnology上，并以标题“Lab on a chip”成为该期封面故事，被当年Science评出的世界科技十大突破Biochip一项所引用。
回国后他站在国际生物芯片研究前沿并结合国情，主持建立了国内急需的疾病预防、诊断和预后分子分型芯片技术体系，领导研制了基因、蛋白和细胞分析所需的多种生物芯片，实现了生物芯片所需全线配套仪器的国产化。
主持研制了生物芯片类产品及配套仪器共50余项，获国外发明专利28项、中国发明专利31项，获国家医疗器械证5个、欧盟CE证书15个，负责起草了5项用于临床诊断的生物芯片行业标准。
实现了国产生物芯片类产品向欧美等发达国家的批量出口，实现销售收入3.4亿元。主编中英文著作各4部，发表SCI论文95篇，他引2000余次。获国家杰出青年科学基金、教育部“长江学者奖励计划”特聘教授、国家技术发明奖二等奖、何梁何利科学与技术创新奖等奖励和荣誉。
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